石灰?guī)r的礦物成分主要為方解石、伴有白云石、菱鎂礦和其他碳酸鹽礦物，還混有其他一些雜質(zhì)。其中的鎂呈白灰石及菱鎂礦出現(xiàn)，氧化硅為游離狀的石英，石髓及蛋白石分布在巖石內(nèi)，氧化鋁同氧化硅化合成硅酸鋁（粘土、長(zhǎng)石、云母）；鐵的化合物呈碳酸鹽（菱鎂礦）、硫鐵礦（黃鐵礦）、游離的氧化物（磁鐵礦、赤鐵礦）及氫氧化物（含水針鐵礦）存在；此外還有海綠石，個(gè)別類型的石灰?guī)r中還有煤、地瀝青等有機(jī)質(zhì)和石膏、硬石膏等硫酸鹽，以及磷和鈣的化合物，堿金屬化合物以及鍶、鋇、錳、鈦、氟等化合物，但含量很低。